1、是两个不同的联赛，

2、CUBA不允许在中国篮协注册的专业运动员参赛，始终把维护业余体育的纯洁性放在第一位，参赛队员必须是通过国家正规考试的全日制在校大学生；

3、大超联赛则首次向在中国篮协注册的专业队员敞开了大门，各高校在引进专业运动员上有了较大的运作空间，与赛季时间没有冲突的CBL球员、青年队球员只要入学手续完备、年龄适合并能提供“在校在读”的证明就可以参赛。 至于水平就很难讲了，参加CUBA的学校众多，水平也参差不齐，只有到了全国八强赛的队伍水平才比较高。至于大超，因为基本是各个俱乐部把年青队员放到本省著名大学（名人效应），所以大超联赛也是名校联赛，但是年青队员年龄一般比参加CUBA的球员小，身体上会吃亏，CUBA的球员要是保研，能打到二十五六岁。从成材率上看，大超暂时还是要高过CUBA。CUBA的球员毕业后一般不走职业篮球这条路，大超联赛可能也是想给那些打不上职业篮球的队员多一条出路吧。大超联赛有一个弊端，就是球队发展不够稳定，本来大学生篮球基本是四年一拨，很短了，但参加大超联赛的学校还要看各职业篮球队给不给人，有些球员在大超打了一年好球，就被要回去了，球队实力起伏比较大。CUBA就不会有这样的烦恼。CUBA和大超的直接对话还没有过，不过间接的还是有的：比如CUBA-CBA青年篮球对抗赛，举行两次，CUBA和CBA青年队各得一次冠军；比如各省大学生运动会，我所在的省，国立华侨大学大比分战胜厦门大学，但厦门大学是大超南区冠军（至于是不是同一拨球员就不知道了，而且夏大是在主场拿下的这个冠军），东北师范大学前年参加亚洲大学生篮球比赛，小组没有出线；华侨大学参加同样的比赛，小组出线，获得第三，半决赛对手就是后来夺冠的韩国球队。还有CUBA第六届冠军电子科技大学，在次年参加大超的成绩也不理想（至于是不是同一拨球员也不知道了），武汉理工大学曾经两线作战，派高考进来的学生球员打CUBA，让职业队的青年球员打大超，至于内部训练比赛的结果就不知道了。所以最好CUBA和大超的冠军来次比赛。不过，最近CUBA发展趋势比较不错，而大超有点停滞不前，记得前几年经常可以看到CCTV5直播，现在连冠军赛都是录播。CUBA的直播场次一直都很有保障。